Sim, você precisa homologar o seu drone!
O fabricante homologa o drone e o controle em processos de Certificação de Conformidade separados. Cada equipamento tem o seu processo próprio e uma numeração e certificado de homologação específico.
Se um dos dois, drone ou controle, não tem a logomarca da ANATEL e uma numeração de homologação, o que não tem precisa ser homologado.
Mas por que um tem a homologação e outro não?
Por que o pacote foi montado para ser vendido em outro país antes de ser homologado aqui no Brasil, e exportado para ser vendido em outro país e só depois veio para o Brasil.
Resumindo, fique dentro das normas e homologue o seu drone ou controle!